| 大白菜BrSPS1Fb基因剪接受体位点变异及其对剪接的影响 |
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| 引用本文： | 陶鹏,岳智臣,赵彦婷,雷娟利,李必元.大白菜BrSPS1Fb基因剪接受体位点变异及其对剪接的影响[J].浙江农业学报,2021,33(11):2068. |
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| 作者姓名： | 陶鹏 岳智臣 赵彦婷 雷娟利 李必元 |
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| 作者单位： | 浙江省农业科学院 蔬菜研究所,浙江 杭州 310021 |
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| 基金项目： | 浙江省自然科学基金(LY21C150006);浙江省农业新品种选育重大科技专项(2017C02065);宁波市农业重大科技专项(2016C11002) |
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| 摘 要： | 为研究剪接受体位点变异对剪接方式与效率的影响,对大白菜材料He2进行重测序,发现BrSPS1Fb-He2第6个内含子(I6)的剪接受体位点由AG突变为AC。对大白菜材料He2花瓣进行转录组测序并分析BrSPS1Fb-He2 read数据,结果显示,BrSPS1Fb-He2在pre-mRNA加工过程中发生了选择性剪接。BrSPS1Fb-He2可选择3个位置(A1、A2和A3)作为受体进行剪接,产生3种剪接异构体(S1、S2和S3),或者保留I6整个内含子,形成S4剪接异构体。大白菜BrSPS1Fb-He2的成熟mRNA中保留部分I6(S1和S2)或全部I6(S4),或者缺失部分E7外显子序列(S3)。综上,BrSPS1Fb剪接受体位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)变异对其转录后剪接产生了显著影响。
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| 关 键 词： | 大白菜 单核苷酸多态性(SNP) 剪接受体位点 SPS1F 选择性剪接 |
| 收稿时间： | 2020-10-28 |
Variation of acceptor splicing site of BrSPS1Fb of Chinese cabbage and its effect on splicing |
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| TAO Peng,YUE Zhichen,ZHAO Yanting,LEI Juanli,LI Biyuan.Variation of acceptor splicing site of BrSPS1Fb of Chinese cabbage and its effect on splicing[J].Acta Agriculturae Zhejiangensis,2021,33(11):2068. |
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| Authors: | TAO Peng YUE Zhichen ZHAO Yanting LEI Juanli LI Biyuan |
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| Institution: | Institute of Vegetables, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310021, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Chinese cabbage single nucleotide polymorphisms (SNP) acceptor splicing site SPS1F alternative splicing |
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