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火龙果HubHLH基因家族的全基因组分析及其对冬季补光诱导开花的表达响应
作者姓名:李佳雪  丁一  王猛  李涛  郭攀阳  刘成立  韦双双  黄家权  李洪立  胡文斌  汤华
作者单位:1. 海南大学三亚南繁研究院/崖州湾种子实验室;2. 海南大学热带作物学院;3. 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
基金项目:海南省自然科学基金高层次人才项目(320RC487);
摘    要:为了获得较完整的候选基因,探讨HubHLH基因在火龙果(Hylocereus undatus)冬季补光诱导开花过程的表达响应,对火龙果HubHLH基因家族进行全基因组分析。鉴定出153个HubHLH基因;这些基因的编码蛋白含有176~687个氨基酸,分子量大小为19.28~74.44 kDa,等电点(pI)为4.81~9.88,均为亲水蛋白,亚细胞定位预测大多定位到细胞核。为鉴定HubHLH基因家族的同源性,本研究将153个火龙果HubHLH和120个拟南芥AtbHLH蛋白进行系统发育比较分析。系统发育比较分析结果:火龙果HubHLH基因家族成员被分为12个组,25个亚族;对HubHLH基因家族的保守motif、基因结构及在染色体的位置分布的分析结果表明,同一亚族的基因具有相似的基序组成和基因结构。对HubHLH基因家族的内部复制事件的分析结果表明,有78条片段复制被鉴定为片段重复基因,说明片段复制是HubHLH基因家族的主要扩张力量。此外,基于已测定的关于火龙果冬季补光诱导开花的4个时期转录组数据,筛选到59个HubHLH基因在冬季补光诱导成花过程中有差异表达,随后对这59个HubH...

关 键 词:火龙果  bHLH基因家族  全基因组  补光诱导开花  基因差异表达
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