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金鱼核糖体转录间隔区(ITS-1)的克隆和序列分析
引用本文:牟希东,白俊杰,汪学杰,罗建仁.金鱼核糖体转录间隔区(ITS-1)的克隆和序列分析[J].淡水渔业,2008,38(1):74-76,43.
作者姓名:牟希东  白俊杰  汪学杰  罗建仁
作者单位:1. 中国水产科学院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,中国水产科学研究院珠江水产研究所,广州,510380;上海水产大学,上海,200090
2. 中国水产科学院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,中国水产科学研究院珠江水产研究所,广州,510380
摘    要:对金鱼(Carassius auratus)核糖体转录间隔区(ITS-1)进行了克隆测序,并对ITS-1序列进行了分析。结果显示,克隆的金鱼ITS-1区序列长度为294bp,其中A、T、G、C 4种碱基的含量分别为17.0%、14.6%、33.0%、35.4%;与从GenBank中检索到的12种鱼的核糖体DNA序列比较显示,其与12种鱼的ITS-1序列同源性较低,在26.0%~61.6%之间;根据金鱼与其他12种鱼的ITS-1序列的同源性构建进化树,所得的分类结果与传统的分类结果基本一致。

关 键 词:金鱼(Carassius  auratus)  核糖体  转录间隔区1(ITS-1)  基因克隆  基因序列
文章编号:1000-6907-(2008)01-0074-03
收稿时间:2007-09-07
修稿时间:2007年9月7日

Cloning and Sequence Analysis of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer 1 From Goldfish(Carassius auratus)
MU Xi-dong,BAI Jun-jie,WANG Xue-jie,LUO Jian-ren.Cloning and Sequence Analysis of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer 1 From Goldfish(Carassius auratus)[J].Freshwater Fisheries,2008,38(1):74-76,43.
Authors:MU Xi-dong  BAI Jun-jie  WANG Xue-jie  LUO Jian-ren
Abstract:The internal transcribed spacer 1(IST-1) from goldfish(Carassius auratus) was cloned,sequenced and analyzed.The result showed a sequence with total length of 294 nucleotides of ITS1.The contents of A,T,G and C were 17.0%,14.6%,33.0%,35.4% in ITS-1 of goldfish.Comparing to ITS-1 sequences of other 12 fishes in GenBank,there were lower homologies from 26.0% to 61.6% between goldfish and other fishes.The evolution tree built from the ITS-1 homology of goldfish and other 12 fishes was consistent with that of traditional taxonomic results.
Keywords:goldfish(Carassius auratus)  ribosomal DNA  internal transcribed spacer 1(IST-1)  gene cloning  DNA sequencing
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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