猪流行性腹泻病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法的建立 |
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引用本文: | 董苏洁,孔宁,秦文珍,翟焕杰,翟雪滢,杨心雨,童武,郑浩,于海,童光志,李有文,单同领.猪流行性腹泻病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法的建立[J].中国动物传染病学报,2024(2):174-180. |
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作者姓名: | 董苏洁 孔宁 秦文珍 翟焕杰 翟雪滢 杨心雨 童武 郑浩 于海 童光志 李有文 单同领 |
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作者单位: | 1. 塔里木大学动物科学与技术学院;2. 中国农业科学院上海兽医研究所 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31872478,32102665,31760741);;上海自然科学基金(19ZR1469100); |
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摘 要: | 为了建立高效、灵敏的猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测方法,本研究从GenBank数据库中获取PEDV N基因序列,扩增出PEDV N基因标准质粒,并在N基因的保守区域内设计了一对特异性荧光定量引物,成功建立了SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。经过一系列试验表明,该检测方法线性关系良好,R2值为0.99;特异性强,敏感性高,最低可检测至2.23 copies/μL,比普通PCR灵敏约100倍;重复性好,组内变异系数为0.25%~0.43%,组间变异系数为0.67%~0.97%;对于各地区96份临床样品检测出PEDV阳性率为25%。本研究建立的实时荧光定量PCR检测方法为PEDV的临床诊断、流行病学调查以及定量研究提供了有效的检测工具。
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关 键 词: | 猪流行性腹泻病毒 N基因 SYBR Green I 荧光定量PCR |
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