| 2018—2020年福建地区猪瘟病毒E0基因遗传变异分析 |
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| 引用本文： | 戴爱玲,张鑫杰,林楚云,尹会方,薛少华,刘建奎,杨小燕.2018—2020年福建地区猪瘟病毒E0基因遗传变异分析[J].中国动物传染病学报,2024(2):201-207. |
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| 作者姓名： | 戴爱玲 张鑫杰 林楚云 尹会方 薛少华 刘建奎 杨小燕 |
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| 作者单位： | 1. 龙岩学院生命科学学院;2. 福建省生猪疫病防控工程技术研究中心;3. 福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室 |
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| 基金项目： | 福建省科技重大专项项目(2019NZ09005)；;龙岩市科技计划重大项目(2019LY1001)； |
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| 摘 要： | 为了了解2018—2020年福建地区猪瘟病毒流行及遗传变异情况，收集福建省不同地区临床发病猪的血液和肺脏、脾脏、淋巴结等组织样本1464份，采用RT-nPCR的方法对样品进行CSFV检测，对部分CSFV阳性样品E0基因进行克隆测序。结果显示，CSFV总体阳性率为1.9%(29/1464)，并获得13株CSFV E0基因序列。同源性分析发现所得13株CSFV E0基因之间的同源性在82.2%-99.7%，其中11株CSFV E0基因与1.1亚型代表毒株HCLV的核苷酸同源性为99.0%～99.9%，与Shimen株的核苷酸同源性94.1%～95.0%；1株与2.1c型参考毒株HNSD-2012核苷酸同源性为98.2%；1株与2.1d亚型毒株CSFV/JPN/2018核苷酸同源性为99.6%。遗传进化分析发现，10株CSFV与HCLV、C-ZJ-2008、Shimen和Brescia处于同一分支，属于1.1亚型；1株CSFV与HNSD-2012等位于同一分支，属于2.1c亚亚型；1株与CSFV/JPN/2018等位于同一分支，属于2.1d亚亚型。氨基酸序列分析发现，13株毒株与HCLV等代...
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| 关 键 词： | 猪瘟病毒 RT-nPCR E0基因 遗传变异 |
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