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假臭草EST-SSRs标记的开发
引用本文:黄 敏,陈振玺,刘建福,王奇志. 假臭草EST-SSRs标记的开发[J]. 热带作物学报, 2014, 34(3): 27-33
作者姓名:黄 敏  陈振玺  刘建福  王奇志
作者单位:华侨大学化工学院 福建厦门 361021;华侨大学化工学院 福建厦门 361021;华侨大学化工学院 福建厦门 361021;华侨大学化工学院 福建厦门 361021
摘    要:从NCBI的dbEST数据库中下载假臭草同族植物的EST序列,经EST序列处理及SSR位点查询,首次设计了27对假臭草EST-SSRs引物,以海南省文昌市假臭草DNA为模板,采用单因素和L16(45)正交试验对其EST-SSRs PCR反应体系进行优化。建立了假臭草EST-SSRs最佳20 μLPCR反应体系:Mg2+浓度为2.75 mmol/L,模板DNA用量为35 ng,Tag DNA聚合酶为2.25 U,dNTPs浓度为0.3 mmol/L,引物浓度为0.6 μmmol/L。并用14个不同来源的假臭

关 键 词:假臭草 ;EST-SSRs ;引物设计 ;优化

Development of Praxelis clematidea EST-SSRs
Abstract:
Keywords:Praxelis clematidea    EST-SSRs    primer design    optimization
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