假臭草EST-SSRs标记的开发 |
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引用本文: | 黄 敏,陈振玺,刘建福,王奇志. 假臭草EST-SSRs标记的开发[J]. 热带作物学报, 2014, 34(3): 27-33 |
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作者姓名: | 黄 敏 陈振玺 刘建福 王奇志 |
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作者单位: | 华侨大学化工学院 福建厦门 361021;华侨大学化工学院 福建厦门 361021;华侨大学化工学院 福建厦门 361021;华侨大学化工学院 福建厦门 361021 |
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摘 要: | 从NCBI的dbEST数据库中下载假臭草同族植物的EST序列,经EST序列处理及SSR位点查询,首次设计了27对假臭草EST-SSRs引物,以海南省文昌市假臭草DNA为模板,采用单因素和L16(45)正交试验对其EST-SSRs PCR反应体系进行优化。建立了假臭草EST-SSRs最佳20 μLPCR反应体系:Mg2+浓度为2.75 mmol/L,模板DNA用量为35 ng,Tag DNA聚合酶为2.25 U,dNTPs浓度为0.3 mmol/L,引物浓度为0.6 μmmol/L。并用14个不同来源的假臭
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关 键 词: | 假臭草 ;EST-SSRs ;引物设计 ;优化 |
Development of Praxelis clematidea EST-SSRs |
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Abstract: | |
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Keywords: | Praxelis clematidea EST-SSRs primer design optimization |
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