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江西部分地区猪粪便戊型肝炎病毒核酸检测及序列分析
引用本文:谢宝东,何后军,潘金发. 江西部分地区猪粪便戊型肝炎病毒核酸检测及序列分析[J]. 中国兽医杂志, 2009, 45(1)
作者姓名:谢宝东  何后军  潘金发
作者单位:1. 江西农业大学动物科技学院,江西,南昌,330045;宝鸡市动物疫病预防与控制中心,陕西,宝鸡,721001
2. 江西农业大学动物科技学院,江西,南昌,330045
基金项目:江西省科技厅一般项目,江西省农业厅重点项目 
摘    要:采集江西省A猪场2~3月龄猪粪便40份,B猪场2~3月龄猪粪便40份,利用反转录套式聚合酶链方法(RT-nPCR),检测戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)RNA,结果表明,A猪场7份样品为阳性,阳性率17.5%.B猪场10份样品为阳性,阳性率25.0%.总阳性率21.3%.对4份PCR扩增阳性产物进行纯化并测序,利用生物学软件进行序列分析和进化树绘制,4个分离株ORF2 348 bp同源性为92.1%~97.5%,为同一基因型,与HEV1、HEV2、HEV3同源性分别为70.7%~77.4%、72.5%~75.7%和71.6%~76.8%,与HEV4型的同源性79.2%~83.9%.4个分离株与HEV4型的代表株T1在同一分支上,属基因4型.与中国大陆6株猪源HEV比较,同源性为79.0%~87.3%,提示中国大陆猪源HEV的基因型比较一致,同属HEV 4型.

关 键 词:戊型肝炎病毒  基因型

Detection of hepatitis E virus in swine feces from Jiangxi pig farms by RT-nPCR
XIE Bao-dong,HE Hou-jun,PAN Jin-fa. Detection of hepatitis E virus in swine feces from Jiangxi pig farms by RT-nPCR[J]. Chinese Journal of Veterinary Medicine, 2009, 45(1)
Authors:XIE Bao-dong  HE Hou-jun  PAN Jin-fa
Abstract:
Keywords:RT-nPCR
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