首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

青海草原毛虫气味结合蛋白基因与生物信息学分析
作者姓名:南彦斌  张月  何啟玥  陈帅  周渊涛
作者单位:青海大学农牧学院, 青海 西宁 810016
基金项目:青海省科技厅青年基金项目,草原毛虫嗅觉感受分子机理的研究(2022-ZJ-949Q)资助
摘    要:青海草原毛虫(Gynaephora qinghaiensis)是危害青藏高原高寒草甸最重要的害虫之一。本研究通过第二代高通量测序技术对青海草原毛虫4龄幼虫、雌雄成虫进行转录组测序并进行基因功能注释,同时筛选获得其气味结合蛋白基因(GqinOBPs)并进行生物信息学分析。结果表明:转录本经过组装之后总计得到63 335条unigenes,在全部unigenes中筛选并鉴定出17个GqinOBPs基因,通过生物信息学分析发现这些气味结合蛋白为热稳定性蛋白,亚细胞定位主要在胞外,二三级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成,多序列比对显示GqinOBPs具有昆虫OBPs的半胱氨酸模式识别序列;系统分析表明,GqinOBPs基因与同是鳞翅目昆虫的桃蛀螟、小线角木蠹蛾和沙棘木蠹蛾亲缘关系较近。该研究首次公开并分析青海草原毛虫转录组数据,同时挖掘出其气味结合蛋白基因,为进一步研究青海草原毛虫的基因功能奠定基础。

关 键 词:青海草原毛虫  转录组测序  气味结合蛋白  生物信息学分析  系统发育树
收稿时间:2022-10-10
点击此处可从《草地学报》浏览原始摘要信息
点击此处可从《草地学报》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号