| 中国荷斯坦牛HSF1基因microRNA SNPs 与耐热性能的相关性研究 |
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| 引用本文： | 李秋玲,鞠志花,贾祥捷,黄金明,李建斌,李荣岭,李芳,王长法,仲跻峰.中国荷斯坦牛HSF1基因microRNA SNPs 与耐热性能的相关性研究[J].中国农业科学,2011,44(3):570-578. |
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| 作者姓名： | 李秋玲 鞠志花 贾祥捷 黄金明 李建斌 李荣岭 李芳 王长法 仲跻峰 |
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| 作者单位： | （山东省农业科学院奶牛研究中心）; |
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| 基金项目： | 国家“863”计划项目(2008AA101010-1); 现代农业产业技术体系建设项目(nycytx-0107); 农业部公益性行业科研专项(nyhyzx07-036-39); 山东省自然科学基金项目(Y2008D56); 山东省农业良种工程项目(2008LZ016-06A) |
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| 摘 要： | 【目的】分析638头中国荷斯坦牛HSF1基因多态性与耐热性的关系,以期为中国耐热奶牛分子育种提供参考依据。【方法】设计引物扩增HSF1基因,通过DNA测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP技术筛查SNPs并分型,利用miRBASE数据库定位microRNA SNPs,利用SHEsis软件进行配对连锁不平衡分析和单倍型构建,利用SAS软件对不同基因型和单倍型组合个体耐热指标包括红细胞钾浓度、产奶量下降率、直肠温度和耐热系数进行相关分析。应用荧光定量RT-PCR技术研究热应激状态下HSF1 mRNA的转录水平。【结果】发现2个microRNA种子序列新 SNPs,T909C和G4693T。其中909位碱基距离microRNA种子序列5'端3 bp,4 693位突变直接使microRNA种子序列破坏。909位点CC、CT基因型奶牛耐热性能显著高于TT基因型（P＜0.05）;4693位点TT基因型奶牛耐热性能显著高于GG基因型（P＜0.05）。共构建出4种单倍型、发现10种单倍型组合。其中H2H4单倍型组合红细胞钾浓度和直肠温度显著低于H1H3单倍型组合（P＜0.05）,耐热系数显著高于H1H3组合（P＜0.05）,H2H4组合个体产奶量下降率显著低于H1H1组合个体（P＜0.05）,H2H4为耐热单倍型组合。热应激状态下HSF1 mRNA的转录水平在不同组织中存在差异,在心脏中最高,是肌肉中的11.24倍（P＜0.05）。【结论】HSF1基因microRNA SNPs可作为奶牛抗热应激的候选分子标记应用于育种实践。
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| 关 键 词： | 中国荷斯坦牛 HSF1 耐热性能 microRNA 多态性 |
| 收稿时间： | 2010-06-10; |
Identification of MicroRNA SNPs of HSF1 Gene and Their Association with Heat Tolerance in Chinese Holstein |
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| LI Qiu-ling,JU Zhi-hua,JIA Xiang-jie,HUANG Jin-ming,LI Jian-bin,LI Rong-ling,LI Fang,WANG Chang-fa,ZHONG Ji-feng.Identification of MicroRNA SNPs of HSF1 Gene and Their Association with Heat Tolerance in Chinese Holstein[J].Scientia Agricultura Sinica,2011,44(3):570-578. |
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| Authors: | LI Qiu-ling JU Zhi-hua JIA Xiang-jie HUANG Jin-ming LI Jian-bin LI Rong-ling LI Fang WANG Chang-fa ZHONG Ji-feng |
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| Institution: | LI Qiu-ling1,JU Zhi-hua1,JIA Xiang-jie1,2,HUANG Jin-ming1,LI Jian-bin1,LI Rong-ling1,LI Fang1,WANG Chang-fa1,ZHONG Ji-feng 1(1Dairy Cattle Research Centre,Shandong Academy of Agricultural Science,Ji'nan 250100,2Zaozhuang Vocational College of Science and Technology,Tengzhou 277500,Shandong) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Chinese Holstein HSF1 thermal tolerance microRNA polymorphism |
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