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基于叶绿体DNA accD-psaI序列分析的广西梨地方品种遗传多样性研究
引用本文:齐丹,曹玉芬,胡红菊,王超,常耀军,田路明,董星光,张莹,霍宏亮,徐家玉,刘超,詹俊宇.基于叶绿体DNA accD-psaI序列分析的广西梨地方品种遗传多样性研究[J].中国南方果树,2019(3):91-93,98.
作者姓名:齐丹  曹玉芬  胡红菊  王超  常耀军  田路明  董星光  张莹  霍宏亮  徐家玉  刘超  詹俊宇
作者单位:中国农业科学院果树研究所/农业部园艺作物种质资源利用重点实验室;湖北省农业科学院果树茶叶研究所
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项(CARS-29-01);中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-2016-RIP)资助
摘    要:为评价广西梨地方品种的遗传多样性水平,对54份广西梨地方品种的叶绿体DNA高变区域accD-psaI进行测序,并与Genbank中42份梨主栽品种(来自白梨、秋子梨、砂梨、新疆梨、西洋梨和选育品种)的accD-psaI序列做比较。对比发现,广西梨地方品种的accD-psaI序列长度为683~936 bp不等,检测出单倍型(H1~H6)数量6个,简约性信息位点1个,单一突变位点5个,插入/缺失(InDels)片段5个,单倍型多样性(Hd)为0.710,核苷酸多样性(Pi)为0.64×10-3。单倍型H1、H2和H3为常见单倍型,其中H1在广西各地分布最为广泛。Median-joining Network图显示,单倍型H4和H5为原始单倍型,H2、H3和H8为较进化单倍型。2个原始单倍型只在横县梨地方品种中检测到,同时横县的单倍型类型最多,推测横县为广西梨起源与多样性中心。

关 键 词:  地方品种  叶绿体DNA  遗传多样性  广西

Genetic Diversity of Pear Landraces in Guangxi Based on DNA accD-psaI Sequences of Chloroplast
QI Dan,CAO Yufen,HU Hongju,WANG Chao,CHANG Yaojun,TIAN Luming,DONG Xingguang,ZHANG Ying,HUO Hongliang,XU Jiayu,LIU Chao,ZHAN Junyu.Genetic Diversity of Pear Landraces in Guangxi Based on DNA accD-psaI Sequences of Chloroplast[J].South China Fruits,2019(3):91-93,98.
Authors:QI Dan  CAO Yufen  HU Hongju  WANG Chao  CHANG Yaojun  TIAN Luming  DONG Xingguang  ZHANG Ying  HUO Hongliang  XU Jiayu  LIU Chao  ZHAN Junyu
Abstract:QI Dan;CAO Yufen;HU Hongju;WANG Chao;CHANG Yaojun;TIAN Luming;DONG Xingguang;ZHANG Ying;HUO Hongliang;XU Jiayu;LIU Chao;ZHAN Junyu
Keywords:
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