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马铃薯SGAs合成代谢途径末端SGT酶基因克隆及序列分析
引用本文:牛继平,张金文,王旺田,王蒂,陆艳梅,张俊莲. 马铃薯SGAs合成代谢途径末端SGT酶基因克隆及序列分析[J]. 草业学报, 2012, 21(3): 106-116. DOI: 10.11686/cyxb20120314
作者姓名:牛继平  张金文  王旺田  王蒂  陆艳梅  张俊莲
作者单位:1. 甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,甘肃兰州730070;甘肃省干旱生境作物学重点实验室,甘肃兰州730070;甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃兰州730070
2. 甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,甘肃兰州730070;甘肃省干旱生境作物学重点实验室,甘肃兰州730070
基金项目:科技部国家重点基础研究发展计划(973计划)前期项目,甘肃省自然科学基金
摘    要: 糖苷生物碱(SGAs)是一类存在于茄科植物和百合科植物的重要次生代谢物,与植物抗逆性和产品品质有密切关系,同时在医药上具有广泛的药理学活性。茄啶:糖基转移酶(SGT)为SGAs合成代谢途径末端关键酶,研究其基因结构及其编码的酶蛋白特性,对于调控植物体内SGAs合成及其通过微生物发酵生产SGTs有重要的作用和意义。通过生物信息学分析方法预测3个糖基转移酶cDNA 编码的酶蛋白结构和特性。以马铃薯块茎表皮总RNA 为模板,采用RT-PCR 的方法扩增出3个糖基转移酶(SGT1、SGT2和SGT3)基因片段并克隆到pMDR19 T载体。阳性克隆经PCR 鉴定后进行测序,序列分析结果表明,克隆到的sgt 1、sgt 2 和sgt 3 三个同源的序列片段(1467~1518bp),编码488~505 个氨基酸;所得序列与GenBank 中注册的高等植物SGT 酶基因核苷酸序列(U82367.2、DQ218276.1和DQ266437)的同源性均在99.12%以上,氨基酸同源性达到99%以上,3个基因都具有UDPG 糖基转移酶保守结构域及许多重要功能位点;PI为5.52~5.62。三级结构预测表明,该氨基酸同糖基转移酶单体结构模型相似,都为糖基转移酶家族成员,具有合成类固醇糖苷生物碱的功能,基因序列已注册到Gen Bank,序列注册号分别为:sgt 1,JN695005;sgt 2,JN695006;sgt  3,HM188447。

关 键 词:马铃薯  糖苷生物碱  茄啶糖苷转移酶  基因克隆  生物信息学分析

Cloning and sequence analysis of terminase gene of glycoalkaloid biosynthesis metabolismic pathway in potato
NIU Ji-ping , ZHANG Jin-wen , WANG Wang-tian , WANG Di , LU Yan-mei , ZHANG Jun-lian. Cloning and sequence analysis of terminase gene of glycoalkaloid biosynthesis metabolismic pathway in potato[J]. Acta Prataculturae Sinica, 2012, 21(3): 106-116. DOI: 10.11686/cyxb20120314
Authors:NIU Ji-ping    ZHANG Jin-wen    WANG Wang-tian    WANG Di    LU Yan-mei    ZHANG Jun-lian
Affiliation:1,2(1.Gansu Key Lab of Crop Improvement&Germplasm Enhancement,Lanzhou 730070,China; 2.Gansu Provincial Key Lab of Aridland Crop Science,Lanzhou 730070, China;3.College of Life Sciences and Technology,Gansu Agricultural University,Lanzhou 730070,China)
Abstract:
Keywords:Solanum tuberosum  glycoalkaloid  solanidine glucosyltransferase  gene cloning  sequence analysis
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