肉兔胚胎期肌肉中miRNA的生物信息学分析

兔肉是一种高蛋白、低脂肪、低胆固醇的健康肉源。miRNA在家兔肌肉的生长发育中起了重要的调控作用。研究利用Solexa测序技术对3只妊娠27 d的新西兰白兔的背最长肌进行了miRNA测序,旨在评估高通量测序在发掘肉兔miRNA中的数据质量,以及解析肉兔胚胎期肌肉组织中miRNA的生物学特征。结果表明,仅前5位碱基的错误率略接近0.5%,其他位置的碱基错误率均远远低于0.5%,说明总体测序质量高,获得的序列可用于后续miRNA的鉴定分析。90%以上的miRNA序列长度在20～24 nt。其中约60%长度为22nt的miRNA,占到了纯净序列的一半以上。其次为23nt,再次为21nt。miRNA长度分布的不平衡可能与miRNA的作用机理和具体生物学功能有关。