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黄瓜SSR-PCR反应体系的优化
引用本文:杨迪菲,秦智伟,王桂玲. 黄瓜SSR-PCR反应体系的优化[J]. 东北农业大学学报, 2006, 37(5): 619-623
作者姓名:杨迪菲  秦智伟  王桂玲
作者单位:东北农业大学园艺学院,黑龙江,哈尔滨,150030;黑龙江省农业科学院园艺分院,黑龙江,哈尔滨,150069;东北农业大学园艺学院,黑龙江,哈尔滨,150030
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)
摘    要:采用L9(34)正交试验设计,研究了黄瓜SSR-PCR反应体系的主要成分对扩增结果的影响,并比较了变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物多态性的差异。结果表明,最适反应体系为:在20μL体系中包括dNTP 200μmol.L-1、Primer 0.4μmol.L-1、Mg2+2.5μmol.L-1、Taq酶0.5μmol和模板DNA60 ng。用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测SSR扩增产物结果更准确。

关 键 词:黄瓜  SSR  体系优化
文章编号:1005-9369(2006)05-0619-05
收稿时间:2006-02-27
修稿时间:2006-02-27

Optimization of SSR-PCR reaction system in cucumber
YANG Difei,QIN Zhiwei,WANG Guiling. Optimization of SSR-PCR reaction system in cucumber[J]. Journal of Northeast Agricultural University, 2006, 37(5): 619-623
Authors:YANG Difei  QIN Zhiwei  WANG Guiling
Abstract:The factors which affected on the SSR-PCR results of cucumber were studied with L9(34) orthogonal design.And comparative analysis of polymorphism of SSR detected on denaturing polyacrylamide gel electrophoresis and agarose gel electrophoresis.The result showed that the optimal reaction system was as follows: the 20 μL reaction system contained dNTP 200 μmol·L-1,Primer 0.4 μmol·L-1,Mg2+ 2.5 mmol·L-1,Taq DNA polymerase 0.5 μmol and DNA template 60 ng.The detection effects of denaturing polyacrylamide gel electro-phoresis were more accurate.
Keywords:SSR
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