| 慈竹4CL基因的克隆及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 胡尚连,曹 颖,黄胜雄. 慈竹4CL基因的克隆及其生物信息学分析[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2009, 37(8): 204-210 |
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| 作者姓名： | 胡尚连 曹 颖 黄胜雄 |
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| 作者单位： | 西南科技大学,生命科学与工程学院,四川,绵阳,621010 |
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| 基金项目： | 四川省应用基础研究基金资助项目，四川省教育厅项目，四川省青年基金资助项目，西南科技大学重点项目 |
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| 摘 要： | 【目的】克隆慈竹木质素生物合成酶4CL基因,研究其序列特征,为今后利用该基因调控慈竹木质素的生物合成研究奠定基础。【方法】参照其他物种4CL基因保守区,设计简并引物,以慈竹幼笋cDNA为模板,克隆到1条750 bp的4CL基因保守区片段。以这条保守区片段为模板,结合5′RACE和3′RACE克隆4CL基因全长序列,并对其进行了生物信息学分析。【结果】成功克隆了慈竹4CL基因全序列,该序列CDS区全长为1 674 bp,编码558个氨基酸;氨基酸序列中存在两大4CL氨基酸保守域(SSGTTGMPKGV和GEICIRG),其中前一个氨基酸保守域的第7个氨基酸位点变为M,与常见的L不同,表明慈竹的4CL基因发生了一定变异。系统进化分析表明,该基因(Na4CL)与水稻的Os4CL4和黑麦草的Lp4CL2具有很高的同源性。【结论】克隆了慈竹木质素合成酶4CL基因全长序列,在GenBank上注册为EU327341,可能与慈竹木质素生物合成有关。
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| 关 键 词： | 慈竹 4CL基因 克隆 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2008-11-25 |
Cloning and bioinformation analysis of 4CL gene in Neosinocalamus affinis |
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| HU Shang-lian,CAO Ying,HUANG Sheng-xiong,SUN Xia,LU Xue-qin,JIANG Yao. Cloning and bioinformation analysis of 4CL gene in Neosinocalamus affinis[J]. Journal of Northwest A&F University（Natural Science Edition）, 2009, 37(8): 204-210 |
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| Authors: | HU Shang-lian CAO Ying HUANG Sheng-xiong SUN Xia LU Xue-qin JIANG Yao |
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| Affiliation: | (Life Science and Engineering College,Southwest University of Science and Technology,Mianyang,Sichuan,621010,China) |
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