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叶绿体atpB-rbcL序列分析在核果类果树系统发育研究中的应用
引用本文:王化坤,陶建敏,渠慎春,马瑞娟,房经贵,娄晓鸣,章镇.叶绿体atpB-rbcL序列分析在核果类果树系统发育研究中的应用[J].果树学报,2010(2).
作者姓名:王化坤  陶建敏  渠慎春  马瑞娟  房经贵  娄晓鸣  章镇
作者单位:南京农业大学园艺学院;江苏省太湖常绿果树技术推广中心;江苏省农业科学院;苏州农业职业技术学院;
基金项目:国家自然科学基金(No.30370987);;江苏省应用基础研究(No.BJ200018)
摘    要:为重建核果类果树的系统发育,选择桃、李、梅、杏、樱桃各4~5个主要种或变种,共24个基因型,测定了其叶绿体非编码区atpB-rbcL序列。以桂樱为外种群,用PAUP软件计算数据集的得分,Modeltest筛选最佳模型和参数,Mega计算遗传距离、变异,最大简约法构建系统发育树。结果表明,1)atpB-rbcL在核果类果树各组间分子进化速率不同,差异公布不均衡;2)樱桃较其他核果类果树原始;李、梅、杏亲缘关系较近,梅、杏关系最近。核果类果树是一个单系群,由一个共同的祖先沿着2个方向进化,一枝进化为樱桃,另一枝沿不同的途径产生桃、李、梅、杏等核果类果树。

关 键 词:核果类果树  系统发育  atpB-rbcL  分子进化

Application of atpB-rbcL noncoding spacer in the phylogeny of stone fruit crops
WANG Hua-kun,TAO Jian-min,QU Shen-chun,MA Rui-juan,FANG Jing-gui,LOU Xiao-ming,ZHANG Zhen.Application of atpB-rbcL noncoding spacer in the phylogeny of stone fruit crops[J].Journal of Fruit Science,2010(2).
Authors:WANG Hua-kun    TAO Jian-min  QU Shen-chun  MA Rui-juan  FANG Jing-gui  LOU Xiao-ming  ZHANG Zhen
Institution:1College of Horticulture;Nanjing Agricultural University;Nanjing;Jiangsu 210095 China;2Taihu Extension Center for Evergreen Fruits Technology;Suzhou;Jiangsu 215107 China;3Jiangsu Academy of Agricultural Sciences;Jiangsu 210014 China;4Suzhou Agricul-tural Professional Technology College;Jiangsu 215008 China
Abstract:In order to reconstruct phylogeny of main stone fruit trees,the atpB-rbcL noncoding spacers of chloroplast DNA from 24 genotypes of peach(Amygdalus persica L.),plum(Prunus salicina Lindl.),apricot(Armeniaca vulgaris Lam.),mei(Armeniaca mume Sieb.) and cherry(Cerasus avium Moench.),4-5 genotypes per species,were sequenced and analyzed.Using Prunus zippeliana as outgroup,the data matrix was tested for scores using 56 evolution models with PAUP,and then the scores were used to screen the best model and paramet...
Keywords:Stone fruits  Phylogeny  atpB-rbcL  Molecular evolution  
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