玉米大斑病菌HST生物合成基因簇的结构和表达分析

【目的】分析玉米大斑病菌寄主选择性毒素（host selective toxin，HST）生物合成基因簇Cluster 397.3的结构，以及该基因簇组成基因在玉米大斑病菌侵染过程中的表达情况，为玉米大斑病菌HST的结构和功能研究奠定基础。【方法】以玉米大斑病菌23号生理小种et28a和01-23菌株，1号生理小种ny001和01-11菌株，玉米感病自交系B37为材料，利用antiSMASH技术预测玉米大斑病菌次生代谢产物合成基因簇，通过Synteny共线性分析获得玉米大斑病菌HST生物合成基因簇Cluster 397.3，并对其基因组成和结构进行分析，再利用RNA-Seq技术分析该基因簇的组成基因在玉米大斑病菌侵染玉米叶片3，5，7，10 d的表达情况。【结果】玉米大斑病菌次生代谢产物合成基因簇Cluster 397.3与交链链格孢（Alternaria alternata）ACT-毒素合成基因簇有保守的共线性，含有1个聚酮合酶（PKS）、1个氨基甲酰磷酸合成酶（CPS）、1个短链脱氢酶/还原酶（SDR）、1个锌结合氧化还原酶（ZOR）、1个保守假定蛋白（CHP）、2个细胞色素P450（P450）及2个耐药转运蛋白（DRT）等9个基因。其中PKS与ACT-毒素合成酶基因ACTTS3同源，编码的聚酮合酶包括PksD、PS-DH、Methyltransf_12、PKS_KR、PKS_NbtC superfamily和NADB_Rossmann superfamily 6个典型结构域。RNA-Seq分析结果表明，将玉米大斑病菌接种玉米叶片3，5，7，10 d后，Cluster 397.3组成基因均能表达，且以3 d时表达量整体较高；除CHP基因外，01-11菌株中基因表达量均显著高于01-23菌株。【结论】Cluster 397.3基因表达差异与玉米大斑病菌生理小种的分化和致病特异性有关，该基因簇可能参与了玉米大斑病菌寄主选择性毒素的生物合成。

Structure and expression analysis of HST synthetic gene Cluster 397.3 in Setosphaeria turcica