| 小麦Ta NAC基因基于可变剪切和micro RNA的转录后调控分析 |
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| 引用本文： | 吕士凯,马小龙,张敏,邓平川,陈春环,张宏,刘新伦,吉万全. 小麦Ta NAC基因基于可变剪切和micro RNA的转录后调控分析[J]. 中国农业科学, 2021, 54(22): 4709-4727. DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2021.22.001 |
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| 作者姓名： | 吕士凯 马小龙 张敏 邓平川 陈春环 张宏 刘新伦 吉万全 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学农学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室,陕西杨凌 712100 |
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| 基金项目： | 陕西省重点研发计划(2019DLNY04-06) |
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| 摘 要： | 【目的】以条锈菌和白粉菌胁迫的普通小麦(Triticum aestivum L.)为研究对象,分析由可变剪切(alternative splicing,AS)形成的TaNAC结构变异转录本,同时分析TaNAC基因的microRNA调控位点,为进一步解析TaNAC基因通过转录后调控参与小麦响应真菌胁迫奠定基础。【方法】普通小麦兼抗种质N9134在被白粉菌和条锈菌分别侵染后,各8个时间点取样并混合,然后从混合样本中克隆得到大量TaNAC转录本。参考中国春小麦基因组注释信息(IWGSC RefSeq v1.1)进行比对,选择由可变剪切形成的TaNAC序列结构变异转录本,分析它们的序列结构特征。利用生物信息学软件和在线工具,对这些TaNAC结构变异转录本编码产物的功能结构域、高级结构、理化性质、亚细胞定位等特征和变异情况进行比对分析。同时,利用洋葱表皮细胞瞬时表达系统验证其中1对TaNAC结构变异转录本的亚细胞定位预测结果,并选取5组TaNAC基因的可变剪切序列结构变异转录本进行酵母转录自激活试验,研究序列结构变异对TaNAC基因转录调控活性的影响。此外,利用miRBase数据库收录的小麦中已...
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| 关 键 词： | 小麦 TaNAC转录因子 microRNA 可变剪切 转录后调控 胁迫响应 |
| 收稿时间： | 2021-02-10 |
Post-transcriptional Regulation of TaNAC Genes by Alternative Splicing and MicroRNA in Common Wheat (Triticum aestivum L.) |
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| L,#xdc,ShiKai,MA XiaoLong,ZHANG Min,DENG PingChuan,CHEN ChunHuan,ZHANG Hong,LIU XinLun,JI WanQuan. Post-transcriptional Regulation of TaNAC Genes by Alternative Splicing and MicroRNA in Common Wheat (Triticum aestivum L.)[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2021, 54(22): 4709-4727. DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2021.22.001 |
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| Authors: | LÜ ShiKai MA XiaoLong ZHANG Min DENG PingChuan CHEN ChunHuan ZHANG Hong LIU XinLun JI WanQuan |
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| Affiliation: | College of Agronomy, Northwest A&F University/State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid Areas, Yangling 712100, Shaanxi |
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