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仿刺参profilin基因全长cDNA的克隆及表达分析
引用本文:董颖,高杉,陈仲,杨爱馥,姜北,关晓燕,王摆,周遵春. 仿刺参profilin基因全长cDNA的克隆及表达分析[J]. 中国农业科技导报, 2013, 15(2): 159-167
作者姓名:董颖  高杉  陈仲  杨爱馥  姜北  关晓燕  王摆  周遵春
作者单位:(辽宁省海洋水产科学研究院, 辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室, 辽宁 大连 116023)
基金项目:国家自然科学基金项目(30972272);辽宁省科技计划项目(2011203005);辽宁省博士科研启动基金(20111072)资助。
摘    要:仿刺参(Apostichopus japonicus)是我国北方沿海重要养殖品种之一。克隆了仿刺参profilin基因全长cDNA序列,并分析了基因的表达规律。该基因cDNA序列全长787 bp,5′-非翻译区(5′-untranslated region,UTR)长205 bp,3′-UTR长204 bp,开放阅读框378 bp,编码125个氨基酸,预测蛋白分子量13.4 kDa。仿刺参Profilin蛋白的PROF保守结构域中含有肌动蛋白互作位点、多聚脯氨酸结合位点和PIP2互作位点。氨基酸序列比对结果显示,仿刺参Profilin与丝盘虫(Trichoplax adhaerens)和囊舌虫(Saccoglossus kowalevskii)相似度最高,为46%。Quantitative real-time PCR结果显示,profilin mRNA在仿刺参未受精卵、受精卵、多细胞期、囊胚期、原肠期、小耳状幼体、中耳状幼体、大耳状幼体、樽型幼体、五触手幼体和稚参11个发育阶段及幼参的体壁、体腔细胞、肠道和呼吸树中均有表达;在仿刺参的不同发育阶段中,未受精卵至原肠期profilin mRNA表达量低,从小耳状幼体至稚参表达量增高;在仿刺参的不同组织中,profilin mRNA在体腔细胞中的表达量最高。经过棘皮动物免疫系统有效激活物脂多糖LPS的刺激,体腔细胞中profilin mRNA表达量显著升高,为仿刺参养殖病害的防控提供科学依据。

关 键 词:仿刺参  profilin  序列分析  基因表达  LPS刺激,

Full-length cDNA Cloning and Expression Analysis of Profilin Gene from Sea Cucumber (Apostichopus japonicus)
DONG Ying,GAO Shan,CHEN Zhong,YANG Ai-fu,JIANG Bei,GUAN Xiao-yan. Full-length cDNA Cloning and Expression Analysis of Profilin Gene from Sea Cucumber (Apostichopus japonicus)[J]. Journal of Agricultural Science and Technology, 2013, 15(2): 159-167
Authors:DONG Ying  GAO Shan  CHEN Zhong  YANG Ai-fu  JIANG Bei  GUAN Xiao-yan
Affiliation:(Liaoning Key Laboratory of Marine Fishery Molecular Biology, Liaoning Ocean and Fisheries Science Research Institute, Liaoning Dalian 116023, China)
Abstract:
Keywords:sea cucumber (Apostichopus japonicus)  profilin  sequence analysis  gene expression  LPS challenge  
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