| 基于454测序的碧桃花瓣组织转录组核苷酸变异1） |
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| 引用本文： | 陈赢男,戴晓港,马秋月,刘海琳,李淑娴.基于454测序的碧桃花瓣组织转录组核苷酸变异1）[J].东北林业大学学报,2014(12). |
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| 作者姓名： | 陈赢男 戴晓港 马秋月 刘海琳 李淑娴 |
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| 作者单位： | 南京林业大学，南京，210037 |
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| 基金项目： | 1)国家自然科学基金，江苏省自然科学基金，江苏省南方现代林业协同创新项目，江苏高校优势学科建设工程(PAPD)资助。 |
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| 摘 要： | 通过对碧桃花瓣组织进行转录组测序，获得1556684条序列，平均读长446 bp，共计695．34 Mb数据，其中1492289条高质量序列经拼接后得到22762个重叠群。以拼接后的重叠群作为参考序列，利用SNP／InDel分析软件检测碧桃花瓣组织转录组中的核苷酸变异位点，共得到9836个SNP和1550个InDel位点。在SNP位点中，转换占62．55％、颠换占37．45％，A／G的变异最为丰富，C／G的变异最少。在InDel位点中，有34．71％的位点为单核苷酸插入、缺失突变。
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| 关 键 词： | 碧桃 转录组测序 单核苷酸多态性 插入缺失长度多态性 |
I denit fication an d Characterizta ion of Nu cleo tide Variations in the Trancs riptome fo Ornamental Peach Flower Petals Based on 454 Se quencing |
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| Chen Yingnan,Dai Xiaogang,Ma Qiuyue,Liu Hailin,Li Shuxian.I denit fication an d Characterizta ion of Nu cleo tide Variations in the Trancs riptome fo Ornamental Peach Flower Petals Based on 454 Se quencing[J].Journal of Northeast Forestry University,2014(12). |
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| Authors: | Chen Yingnan Dai Xiaogang Ma Qiuyue Liu Hailin Li Shuxian |
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