偏肿革裥菌GMC基因家族在木质条件下转录表达分析

为揭示偏肿革裥菌（Lenzites gibbosa）在分解木材过程中葡萄糖-甲醇-胆碱氧化还原酶（Glucosemethanol-choline oxidoreductases, GMCs）基因的功能，采用高通量测序技术对L. gibbosa分解木屑过程中0,3,5,7,11 d的菌丝体进行转录组测序，以Count值与校正后的FPKM值为表达量进行基因筛选。分析基因表达量变化情况及在eggNOG,COG,GO,KEGG,NR,SwissProt和Pfam等数据库中的功能注释结果，通过qPCR验证基因表达量。根据基因注释结果共筛选到23个GMCs基因，表达量变化表明其中有9个是差异基因。功能注释及富集结果表明，L. gibbosa的GMCs至少有6种，分别为纤维二糖脱氢酶、葡萄糖氧化酶、吡喃糖脱氢酶、L-山梨糖1-脱氢酶、醇氧化酶、吡喃糖氧化酶，属于CAZy-AA3家族下的4个亚家族，在木材木质素与综纤维素的降解过程中，它们主要参与能量转运和代谢有关的碳代谢、甲烷代谢、氨基酸代谢和脂质代谢；GMCs与木质素降解过程中H2O2的形成有特定关系，可与FAD结合，将初级醇基氧化形成醛并释放H2...