牦牛源产细菌素屎肠球菌SWUN5732基因组测序及抑菌相关基因分析

【目的】本研究旨在通过研究1株牦牛源产细菌素屎肠球菌SWUN5732的基因组序列，发掘该菌种的关键功能性特征基因。【方法】通过Illumina PE150测序系统，对屎肠球菌SWUN5732进行基因组测序，并在GO、KEGG、COG和NR数据库对基因组的基本功能特征进行注释，结合NR数据库的注释，挖掘出基因组中潜在的抗菌、抗氧化和抑菌肽相关基因。【结果】屎肠球菌SWUN5732的基因组大小为2 824 168 bp,有效平均GC含量约为38.09%;可检测到的编码基因数量约为2 919个，全部编码基因总长度约为2 387 787 bp,平均长度约为818 bp。在GO数据库中SWUN5732基因组一共有8 851个基因得到注释，分别注释到分子功能、细胞组分和生物过程三大类45个条目；在KEGG数据库中SWUN5732基因组共有1 534个基因被注释，分别为细胞过程、环境信息处理、遗传信息处理、人类疾病、新陈代谢和生物体系统6大功能38个通路；在COG数据库中，SWUN5732基因组共有2 118个基因被注释，在基因组中还包含4个有ABC型氨基酸转运系统(渗透酶组分)的功能序列和具有重复...