绵羊超数排卵卵巢差异表达基因及生物信息学分析

【目的】筛选出影响经超数排卵处理的多浪羊卵巢卵泡发育的关键基因、生物过程及信号通路，为进一步了解多浪羊超数排卵状态下卵巢生长发育机制提供依据。【方法】对15只2～3岁身体状况良好的多浪羊进行超数排卵处理后，采集超数排卵中早期(第11天)、中期(第13天)、晚期(第15天)卵巢组织，利用高通量测序技术进行转录组测序，将测序得到的reads序列与参考基因组进行序列比对，筛选出差异表达基因；通过STRING数据库对差异表达基因进行蛋白互作网络分析，采用Cytoscape软件进行可视化编辑处理，利用eggNOG-mapper软件进行GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】超数排卵卵巢第11和13天共筛选出223个差异表达基因，获得259条互作关系，差异表达基因显著注释在细胞生长、核糖核蛋白复合等条目中，其中显著差异表达的基因为ITGB3和SNAI1,未发现显著富集通路。超数排卵卵巢第13和15天共筛选出694个差异表达基因，获得785条互作关系，差异表达基因显著注释在DNA复制的启动、DNA复制、DNA新陈代谢过程等条目中，其中显著差异表达的基因主要有CASP3、NOTCH1、WNT2和RUN...