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猪种布鲁氏菌TIR结构域蛋白的生物信息学分析、重组表达及蛋白互作研究
作者姓名:李倩倩  蔺思函  王丽媛  杨兵兵  张明达  沈秀丽  杜志强
作者单位:1. 内蒙古科技大学生命科学与技术学院;2. 内蒙古科技大学图书馆
基金项目:内蒙古自治区自然科学基金(2020JQ03);;国家自然科学基金(32060834);
摘    要:【目的】本研究以猪种布鲁氏菌Toll/白介素-1受体(TIR)结构域蛋白(Brucella suis TIR domain containing protein, Bs-TDCP)为研究对象,进行基因克隆、生物信息学分析及蛋白互作研究,为后续开发适合动物或人类使用的有效布鲁氏菌疫苗奠定基础。【方法】利用GenBank数据库查找黑腹果蝇髓样分化因子88(Dm-MyD88)和人MyD88(Hs-MyD88)基因序列,设计特异性引物进行基因序列扩增。根据猪种布鲁氏菌测序结果,获得Bs-TDCP基因序列。通过ExPASy、SWISS-MODEL、TMHMM、SMART等在线工具分析Bs-TDCP蛋白理化性质、二级和三级结构、跨膜及功能结构域,并进一步研究Bs-TDCP蛋白与Toll样受体(TLRs)信号通路的关键胞内配体MyD88分子之间的蛋白串扰。【结果】猪种布鲁氏菌TIR结构域蛋白Bs-TDCP基因的开放阅读框(ORF)大小为828 bp,编码275个氨基酸,其中丙氨酸占12.7%,分子式为C1345H2196N390O

关 键 词:猪种布鲁氏菌  TIR结构域  髓样分化因子88(MyD88)  蛋白功能
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