竹鼠源细小病毒分离鉴定及全基因组序列分析

【目的】了解并掌握广西地区竹鼠细小病毒(Bamboo rat parvovirus, BRPV)的生物学特性及遗传变异情况，为BRPV的防控提供理论依据和技术支撑。【方法】用养殖场患病死亡的竹鼠病料制备组织上清液，采用Vero细胞同步接毒法进行病毒分离，通过细胞病变观察、PCR、透射电镜观察及血凝试验等方法鉴定，设计合成特异性扩增引物对BRPV全基因组序列进行测序分析。【结果】分离获得的病毒可在Vero细胞上稳定生长增殖，感染细胞变长、变梭或成拉丝状；病毒纯化后经电镜观察可见呈立体对称、无囊膜、直径20～25 nm的病毒粒子；经PCR鉴定、凝集试验及全基因组测序表明，分离株为BRPV。本研究共获得3株BRPV(GenBank登录号：MF497824、MF497825、MF497826),毒株基因组全长约4 758 bp,全基因组序列比对发现，其与蝙蝠源细小病毒关系较近。BRPV基因编码氨基酸遗传特征与其宿主特异性有很强的相关性，NS1基因编码氨基酸变异与蝙蝠及大鼠源细小病毒更接近，与其处于同一分支，核苷酸相似性为96.9%～97.6%,氨基酸相似性为97.5%～98.4%。其中第257...