鸭胸肌矿物元素含量全基因组关联分析 |
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引用本文: | 余大新,刘文静,刘大鹏,刘同,张鹤,盖凯,李姝楠,张贝贝,侯水生,周正奎.鸭胸肌矿物元素含量全基因组关联分析[J].中国畜牧兽医,2023(4):1287-1295. |
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作者姓名: | 余大新 刘文静 刘大鹏 刘同 张鹤 盖凯 李姝楠 张贝贝 侯水生 周正奎 |
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作者单位: | 1. 青岛农业大学动物科技学院;2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 |
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基金项目: | 中国农业科学院科技创新工程重大科研任务(CAAS-ZDRW202104); |
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摘 要: | 【目的】试验旨在利用全基因组关联分析(GWAS)鉴定影响鸭胸肌矿物元素含量的候选基因及分子标记,解析矿物元素性状的遗传机制。【方法】研究构建了北京鸭×野鸭F2代资源群体,利用个体血液样本进行全基因组重测序,采集8周鸭胸肌并根据国标方法测定7种常量矿物元素含量,结合重测序数据与矿物元素表型数据进行全基因关联分析,鉴定影响矿物元素含量相关基因。【结果】7种矿物元素的表型遗传力分别为磷(0.007)<铁(0.100)<镁(0.120)<钠(0.140)<钾(0.150)<钙(0.190)<锌(0.350)。相关性分析结果表明,镁和钾元素相关性最高(r=0.62),磷与镁、钾元素在鸭胸肌中的含量呈现较高的正相关,r值分别为0.43和0.56。通过GWAS鉴定出与锌元素含量显著相关的1个SNP位点在6号染色体12 075 283 bp处达到全基因组水平上的显著关联(-log10P-value=8.03),与最高点SNP高度相关的39个SNPs将候选区间缩小至39 kb,该区间内仅存在1个基因SORCS3,结合基因功能注释与转录组分析确定S...
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关 键 词: | 鸭 胸肌 矿物元素 全基因组关联分析 遗传力 |
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