基于网络药理学及分子对接探究益母草碱治疗肠道炎症的分子机制 |
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作者姓名: | 许丞惠 张旭梅 杨彤 李嘉蕙 孙亚伟 史慧君 付强 杨莉 |
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作者单位: | 1. 新疆农业大学动物医学学院;2. 新疆草食动物新药研究与创制重点实验室;3. 新疆农业大学畜牧学博士后流动站 |
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基金项目: | 新疆维吾尔自治区自然科学基金青年科学基金(2022D01B21);;国家博士后面上资助(2020M673644XB);;国家自然科学基金(32260902); |
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摘 要: | 【目的】运用网络药理学、分子对接和动力学模拟技术研究益母草碱治疗肠道炎症的分子机制。【方法】采用Pubchem、PharmMapper和SwissTargetPrediction数据库收集益母草碱与肠道炎症的潜在靶点,利用Venny 2.1在线作图工具平台系统获取益母草碱治疗肠道炎症的交集靶点;通过STRING与DAVID数据库获取蛋白-蛋白相互作用(PPI)关系并绘制交集靶点的PPI网络图,对交集靶点进行GO功能与KEGG通路富集分析,运用Cytoscape 3.8.2软件筛选得到核心靶点蛋白,应用分子对接技术与分子动力学模拟对核心靶点进行验证。【结果】共收集到379个与益母草碱相关的潜在靶点蛋白,15 464个与肠道炎症相关的潜在靶点,获得170个益母草碱治疗肠道炎症的潜在交集靶点,筛选出丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、抑癌基因TP53、前列腺素氧化环化酶2(PTGS2)、雷帕霉素靶蛋白(mTOR)、多聚ADP核糖聚合酶1(PARP1)等16个核心靶点。GO功能及KEGG通路富集分析结果显示,益母草碱通过调控蛋白质磷酸化、细胞增殖、凋亡过程负调控、蛋白水解、炎症反应等144个...
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关 键 词: | 益母草碱 肠道炎症 网络药理学 分子对接 分子动力学模拟 作用机制 |
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