高温胁迫下罗非鱼源无乳链球菌的比较转录组分析

【目的】从分子水平了解高温季节罗非鱼无乳链球菌病容易暴发的原因。【方法】在35和28℃分别培养无乳链球菌，提取总RNA并进行转录组测序；利用华大基因Dr.Tom自主分析平台进行差异表达基因分析，并针对差异基因进行了KEGG通路和GO功能的分类和富集；通过实时荧光定量PCR随机检测10个基因的差异表达，确定转录组数据的可靠性。【结果】共得到35和28℃培养条件下的显著性差异表达基因357个，其中上调基因229个，下调基因128个；GO数据库富集能得到多个具有显著性的功能集，多集中在碳源代谢相关的途径，包括碳水化合物分解代谢过程(carbohydrate catabolic process)、糖原代谢过程(glycogen metabolic process)、细胞葡聚糖代谢过程(cellular glucan metabolic process)等；差异基因中发现了多个与无乳链球菌致病性相关的基因，如烷基过氧化氢还原酶亚基、cAMP因子、C5a肽酶等编码基因；实时荧光定量PCR与转录组数据间皮尔逊相关系数R值为0.979(P<0.001),说明转录组数据可靠有效。【结论】高温能够显...