贵州白山羊MyoG基因启动子区序列克隆及生物信息学分析 |
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作者姓名: | 宋兴超 孟金柱 赵园园 吴震洋 安清明 |
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作者单位: | 铜仁学院农林工程与规划学院贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室 |
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基金项目: | 贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2020]1Y029、黔科合基础[2020]1Y138);;贵州省重点实验室项目(黔科合平台人才[2020]2003号); |
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摘 要: | 【目的】本研究旨在解析肌细胞生成素(MyoG)基因启动子区序列的结构特性及其转录调控机制。【方法】以贵州白山羊血液基因组DNA为模板,设计2对引物,采用PCR扩增、Sanger测序技术获得MyoG基因启动子区序列,通过DNAStar和Mega 5.0软件分别进行不同物种MyoG基因启动子区序列相似性比对及系统进化树构建,利用生物信息学软件预测分析该序列核心启动子区、转录因子结合位点、顺式作用元件、CpG岛等结构特征。【结果】贵州白山羊MyoG基因启动子区序列长2 334 bp,包括2 092 bp的5′-侧翼序列和242 bp的外显子1,GC含量略低于AT含量。通过不同物种比对分析,贵州白山羊MyoG基因启动子区序列与绵羊、牛、猪、人、小鼠和鸡同源序列相似性分别为98.34%、96.15%、77.76%、74.15%、57.63%和43.04%。系统进化树结果表明,贵州白山羊与绵羊和牛的亲缘关系较近,与鸡的亲缘关系最远。生物信息学结构预测发现,贵州白山羊MyoG基因转录起始位点位于翻译起始密码子ATG上游50 bp, 5′-侧翼区存在1个潜在的启动子区域和1个CpG岛,含有1个TATA...
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关 键 词: | 贵州白山羊 MyoG基因 启动子区 转录因子 生物信息学 |
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