| 苏姜猪不同生长阶段背膘组织差异表达基因及其调控通路分析 |
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| 引用本文： | 倪黎纲,周春宝,徐盼,张亚琴,陶勇,张君胜.苏姜猪不同生长阶段背膘组织差异表达基因及其调控通路分析[J].中国畜牧兽医,2023(7):2595-2605. |
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| 作者姓名： | 倪黎纲 周春宝 徐盼 张亚琴 陶勇 张君胜 |
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| 作者单位： | 1. 江苏农牧科技职业学院;2. 江苏苏姜种猪有限公司 |
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| 基金项目： | 江苏现代农业产业技术体系建设项目(JATS[2021]387)； |
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| 摘 要： | 【目的】比较苏姜猪背膘组织生长发育过程中基因表达谱的差异，挖掘影响背膘组织生长发育的关键基因。【方法】选择1、3、6和8月龄(M1、M3、M6、M8)4个生长时期苏姜猪背膘组织进行高通量转录组测序，组成3个比对组(M1 vs M3、M3 vs M6、M6 vs M8)进行差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)的筛选，并进行功能富集和表达趋势分析。【结果】转录组测序显示，M1 vs M3、M3 vs M6、M6 vs M8组分别筛选到1 869、296、1 257个DEGs。功能富集显示，Wnt信号通路、细胞外基质-受体相互作用等信号通路在M1 vs M3组表现活跃，PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路、丁酸代谢、柠檬酸循环等信号通路在M6 vs M8组表现活跃。基因表达趋势分析显示，富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白(secreted protein, acid and rich in cysteine, SPARC)、组织蛋白酶S(recombinant cathepsin S,CTSS)、Kruppel样因子7(Kruppel-lik...
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| 关 键 词： | 苏姜猪 转录组测序 背膘组织 差异表达基因 |
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