| miR-192进化分析、靶基因预测及组织表达分析 |
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| 引用本文： | 常艺通,张维,彭英林,陈晨.miR-192进化分析、靶基因预测及组织表达分析[J].中国畜牧兽医,2023(3):882-892. |
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| 作者姓名： | 常艺通 张维 彭英林 陈晨 |
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| 作者单位： | 1. 湖南农业大学动物科学技术学院;2. 湖南省畜牧兽医研究所 |
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| 基金项目： | 湖南省自然科学基金项目(2021JJ30386)；;湖南省重点研发计划项目(2020NK2024、2019NK2193)；;湖南省重点实验室开放研究基金项目(2017TP1030)； |
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| 摘 要： | 【目的】研究miR-192的生物进化进程和潜在靶基因功能，以及miR-192在大围子猪(脂肪型猪)和大约克夏猪(瘦肉型猪)脂肪组织中的差异表达。【方法】利用miBase数据库获取miR-192成熟序列，并利用Ensembl数据库定位miR-192在不同物种基因组的分布特征；采用Mega 11.0软件程序构建miR-192系统进化树；通过实时荧光定量PCR检测miR-192在大围子猪和大约克夏猪背部脂肪组织中的表达情况，并比较表达差异；利用不同在线网站预测猪miR-192靶基因，并对靶基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】miR-192在生物进化过程中具有高度保守性；实时荧光定量PCR结果显示，miR-192在大围子猪背部脂肪组织的表达量极显著高于大约克夏猪(P<0.01));GO功能和KEGG通路富集分析结果表明，miR-192靶基因主要起转录前调节和结合的作用，且主要在染色质和细胞核中发挥作用，多数基因富集在与脂肪代谢相关的信号通路；对3个网站不同物种预测结果取交集共获得猪miR-192保守靶基因5个。【结论】miR-192在生物进化过程中具有高度保守性，可能通过靶向...
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| 关 键 词： | 猪 miR-192 进化分析 脂肪组织 靶基因 |
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