基于网络药理学和分子对接分析赤芍抗氧化应激作用的活性成分及其机制 |
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作者姓名: | 豆佳红 王梓颖 杨娟 周炜炜 张同存 何红鹏 戴小枫 李秀梅 |
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作者单位: | 1. 天津科技大学生物工程学院;2. 中国农业科学院饲料研究所农业农村部饲料生物技术重点实验室 |
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基金项目: | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610382021003); |
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摘 要: | 【目的】利用网络药理学及分子对接技术分析赤芍抗氧化应激作用的有效活性成分及其分子机制。【方法】运用TCMSP数据库搜集赤芍的活性成分和靶点,借助UniProt数据库对靶点进行基因名转化;通过GeneCards和OMIM数据库检索氧化应激的相关基因,利用Veeny在线平台获得赤芍与氧化应激的交集靶点,将交集靶点上传至STRING数据库和Cytoscape 3.8.0软件建立蛋白互作(PPI)网络图和赤芍-靶点-氧化应激可视化网络并进行拓扑学分析,筛选关键靶点;运用Metascape数据库对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,确定赤芍发挥抗氧化应激作用的活性成分和信号通路;运用AutoDock和PyMol软件对赤芍发挥抗氧化应激作用的核心靶点进行分子对接验证。【结果】共筛选到12个赤芍活性成分,包括黄芩素、β-谷甾醇、鞣花酸、豆甾醇、(+)-儿茶素等;赤芍活性成分与氧化应激靶点分别有76和4 873个,其中赤芍与氧化应激交集靶点共69个,包括蛋白激酶B(AKT1)、转录因子AP-1(JUN)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、肿瘤坏死因子(TNF)和半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)等...
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关 键 词: | 赤芍 抗氧化应激 作用机制 网络药理学 分子对接 |
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