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秦川牛PLAG1基因启动子克隆及转录因子预测
作者姓名:马勇  陈宗昌  李旭鹏  李静生  白彦斌  刘占鑫  魏亚丽  郭达山  石斌刚  赵志东  罗玉柱  胡江  王继卿  刘秀  李少斌
作者单位:甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室
基金项目:甘肃农业大学科技创新基金-青年导师扶持基金(GAU-QDFC-2022-07);;甘肃农业大学学科团队项目(GAU-XKTD-2022-22);
摘    要:【目的】探究秦川牛多形性腺瘤基因1(pleomorphic adenoma gene 1,PLAG1)的组织表达规律,并克隆其启动子区序列,预测分析其关键转录因子结合位点,为探究其转录调控机制提供理论参考。【方法】采集3头20月龄秦川牛成年公牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最长肌、瘤胃组织,用实时荧光定量PCR方法检测PLAG1基因在不同组织中的相对表达量,同时克隆PLAG1基因上游启动子区序列,利用生物信息学软件预测PLAG1基因转录起始位点及启动子核心区域,分析、筛选核心启动子区域的关键转录因子结合位点。【结果】PLAG1基因在秦川牛各组织中均有表达,且在背最长肌中的表达量显著高于其他组织(P<0.05)。PLAG1基因启动子序列全长1 861 bp,生物信息学预测分析发现PLAG1基因核心启动子区位于-297―+42 bp,存在高度保守的Krüppel样因子5(KLF5)、cAMP反应元件结合蛋白1(CREB1)和早期生长反应因子1(EGR1)转录因子结合位点,且CpG岛位于PLAG1基因核心启动子区域内。【结论】PLAG1基因在肌肉组织中高表达,其核心启动子区...

关 键 词:秦川牛  PLAG1基因  启动子  转录因子
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