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适合于狗尾草属遗传分析的ISSR标记筛选及反应体系优化研究
引用本文:李伟,智慧,王永芳,李海权,刁现民.适合于狗尾草属遗传分析的ISSR标记筛选及反应体系优化研究[J].华北农学报,2007,22(4):141-145.
作者姓名:李伟  智慧  王永芳  李海权  刁现民
作者单位:河北省农林科学院谷子研究所,河北,石家庄,050031;河北省农林科学院谷子研究所,河北,石家庄,050031;河北省农林科学院谷子研究所,河北,石家庄,050031;河北省农林科学院谷子研究所,河北,石家庄,050031;河北省农林科学院谷子研究所,河北,石家庄,050031
基金项目:国家自然科学基金(30630045),农业部种植业结构调整项目(050501B),河北省自然科学基金资助课题(C2004000697)
摘    要:利用公共数据库已有的ISSR序列信息,检验了29条ISSR引物在谷子等狗尾草属植物基因组的扩增性,其中14条在狗尾草属中有良好扩增,其余15条在狗尾草属中无任何扩增。能稳定扩增的14条引物全为3'-锚定引物,6条5'-锚定引物在狗尾草属中得不到扩增。研究发现AG,GA和CA重复的引物在狗尾草属植物有较好扩增,且多态性强。利用正交试验设计,从Mg2 、dNTP、引物、Taq酶4种因素、4个水平对狗尾草属谷子ISSR反应体系进行优化,确定了适合谷子的ISSR反应体系,在20μL体系中,含1×PCR buffer、Mg2 浓度2.0 mmol/L,dNTP浓度0.25 mmol/L,Taq酶0.4μL,引物浓度0.25μmol/L,50 ng模板,通过梯度PCR确定了引物的退火温度。本研究筛选的ISSR引物及建立的优化反应体系可用于谷子等狗尾草属植物遗传多样性和基因组研究,并对其他近缘作物有指导意义。

关 键 词:谷子  ISSR标记  狗尾草属
文章编号:1000-7091(2007)04-0141-05
修稿时间:2007-04-10

Screening of ISSR Primers that Suitable for Setaria Species and Their PCR Reaction System Optimization
LI Wei,ZHI Hui,WANG Yong-fang,LI Hai-quan,DIAO Xian-min.Screening of ISSR Primers that Suitable for Setaria Species and Their PCR Reaction System Optimization[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2007,22(4):141-145.
Authors:LI Wei  ZHI Hui  WANG Yong-fang  LI Hai-quan  DIAO Xian-min
Institution:National Millet Improvement Center of China, Institute of Millet Crops, Hebei Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Shijiazhuang 050031, China
Abstract:
Keywords:Foxtail millet  ISSR marker  Sataria
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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