威氏绿绒蒿花色形成过程的转录组分析 |
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作者姓名: | 左杰 郭小雪 严朋飞 刘建 屈燕 |
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作者单位: | 西南林业大学园林园艺学院,园林植物与观赏园艺省高校重点实验室,国家林业局西南风景园林工程技术研究中心,云南省功能性花卉资源及产业化技术工程研究中心 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31460218); |
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摘 要: | 为明确威氏绿绒蒿花色变化的机制,本研究以威氏绿绒蒿(Meconopsis wilsonii)为实验对象,选择花蕾期、开裂期及全展期3个阶段的花瓣进行转录组测序,根据各发育期基因差异表达的特点,筛选出与花色变化相关基因。采用荧光定量RT-qPCR对差异表达基因进行验证,结果显示,花瓣转录组测序共生成153 596个unigene,平均长度为1 372 bp。通过KEGG、GO数据库的注释,有134条基因注释到与花色相关的合成通路—类黄酮代谢通路中。针对unigene完成相关序列预测工作,产生的CDS总量为80 240个。花蕾期、开裂期及全展期间两两比较显示,开裂期相对于花蕾期有15 064个基因上调,49 153个基因下调、全展期相对花蕾期有19 732个基因上调,42 890个基因下调、全展期相对开裂期有19 215个基因上调,9 510个基因下调。通过对差异表达基因的代谢通路进行分析,发现在威氏绿绒蒿蓝紫色花色形成过程中不存在飞燕草素合成途径。除此之外还筛选了花青苷合成途径中与花色相关的7个基因,经RT-qPCR实验也表明这些基因在整个过程中的表达模式与RNA-Seq数据呈现出一致性...
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关 键 词: | 绿绒蒿 花色 转录组测序 CDS预测 |
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