甘薯全基因组SBP-box基因家族鉴定及表达分析

SBP (SQUAMOSA promoter binding proteins)家族是植物特有的一类转录因子家族，广泛存在于绿色植物中，调控植物生长发育、信号转导及响应非生物胁迫等多种生理过程。已有多种植物SBP-box基因相继被报道。为探究SBP-box基因在甘薯中的分布情况及对甘薯生长发育的影响，本研究从甘薯全基因组鉴定出30个SBP-box基因，依次命名为IbSPL1～IbSPL30，并分析了其基因结构、蛋白质结构和理化性质、系统进化关系、串联重复、启动子顺式作用元件分布和组织特异表达情况等。结果表明大部分甘薯SBP-box蛋白理化性质、结构有一定分化，甘薯SBP-box蛋白与拟南芥同源进化关系较近，不同亚家族间具有不同数量和类型的motif分布；甘薯SBP-box基因在染色体上分布较为均匀，除3条染色体外，其余12条染色体均有1～4个SBP-box基因分布，共线性分析发现甘薯SBP-box基因可能来源于多次片段重复事件；通过启动子区域顺式作用元件分析和不同组织、不同处理下的差异表达分析，发现16个基因与甘薯地上部分的生长发育相关，7个基因与干旱胁迫响应相关。本研究从各个角度分析...