矮腥黑粉菌胁迫的小麦全基因组重测序与转录组联合分析

为揭示矮腥黑粉菌胁迫下的小麦抗感品种间遗传背景差异，筛选小麦抗矮腥黑穗病候选基因。本研究以小麦感病品种‘伊犁053’和中抗品种‘中麦175’为研究对象，在接种矮腥黑粉菌后对籽粒组织进行重测序与转录组测序的联合分析。经过差异InDel分析后，共有69 840个变异基因与转录组数据进行了联合分析，有7 300个基因在小麦发病籽粒组织中有表达，有162个(2.22%)基因呈极显著差异表达，且基因表达量倍数变化≥1.5倍(‘中麦175’相对于‘伊犁053’,有125个上调, 37个下调)；经过差异SNP分析后，共有98 331个变异基因与转录组数据进行了联合分析，有7 438个基因在小麦发病籽粒组织中有表达，有126个(1.69%)基因呈极显著差异表达，且基因表达量倍数变化≥1.5倍(‘中麦175’相对于‘伊犁053’,有86个上调, 40个下调)。本研究成功揭示了在矮腥黑穗病胁迫下抗感病小麦品种间的遗传差异表达信息，为进一步筛选小麦抗矮腥黑穗病候选基因提供参考。