油茶Aux/IAA基因家族的鉴定与分析

为了获取油茶Aux/IAA基因家族的分布和结构特征，利用HMM进行油茶全基因组Aux/IAA基因的鉴定。结果表明，油茶Aux/IAA基因非均匀分布在10条染色体上；序列长度和外显子数量差异较大，氨基酸长度范围在132～1 085之间，外显子数量为2～16个，同一系统发育亚组上的基因具有类似的外显子数量和基序结构；油茶Aux/IAA部分基因具备响应生长素的顺式作用元件外，还具备其他激素响应的基序和光响应元件。转录组数据表明，CoIAAChr12＿3、CoIAAChr7＿5、CoIAAChr9＿3、CoIAAChr9＿4、CoIAAChr7＿6基因在油茶花芽、花瓣、萼片、雄蕊、雌蕊中高表达，可能与花的形成和发育相关。CoIAAChr12＿5在油茶种子中高表达，可能与油茶种子发育相关。本研究为Aux/IAA基因家族在油茶中的系统研究提供了基础。