白桦SAUR基因家族鉴定及生物信息学分析

SAUR基因家族作为植物生长素早期响应基因家族中最大的一个家族，参与到植物细胞伸长、果实发育、胁迫应答等多个生物学过程。本研究基于白桦全基因组数据，对白桦SAUR基因家族进行鉴定和生物信息学分析。结果表明，白桦共有61个SAUR家族基因，这些基因不均匀分布在14条染色体上，理化性质分析表明，大部分BpSAUR蛋白呈碱性，为不稳定蛋白，脂溶性系数较高，为亲水性；系统进化和基因结构分析表明，61个白桦SAUR基因被分为4类(GroupⅠ～GroupⅣ)，其中GroupⅣ中BpSAUR基因最多，同一分类的BpSAUR基因更倾向于在染色体上聚集分布，大部分白桦SAUR家族基因为无内含子或少内含子基因。白桦SAUR家族基因启动子还拥有多个光响应、激素响应元件与逆境胁迫作用元件，说明其可能参与白桦生长发育及胁迫应答等多个生物学过程。该家族基因在白桦的不同组织部位和不同发育阶段的表达量也不同，主要在幼茎、成熟茎和成熟叶中集中表达。本研究通过对白桦SAUR基因家族进行深入分析，以期为白桦分子育种奠定良好基础。