毛果杨MGT基因家族全基因组水平鉴定及表达分析 |
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引用本文: | 栾雪,张洋,王瑞琪,刘聪,姜廷波,魏志刚.毛果杨MGT基因家族全基因组水平鉴定及表达分析[J].分子植物育种,2024(9):2785-2792. |
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作者姓名: | 栾雪 张洋 王瑞琪 刘聪 姜廷波 魏志刚 |
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作者单位: | 1. 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室;2. 中国林业科学研究院国家林业和草原局盐碱地研究中心 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31770640);;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(CAFYBB2020ZA005)共同资助; |
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摘 要: | 为探究MGT基因家族在毛果杨生长发育及响应胁迫中的作用,本研究在毛果杨全基因组范围,通过生物信息学分析PtrMGT基因家族成员的数量、进化关系、染色体位置、基因结构、编码蛋白基本特征、启动子顺式作用元件,并对各成员的组织表达特异性以及对NaCl胁迫与ABA处理的响应特性进行了分析。结果表明:PtrMGT家族共含有10个基因,可分为4个亚族;有2对同源基因且Ka/Ks值均小于1;家族成员启动子区含有数量不等的非生物胁迫响应元件,共12种、146个元件;PtrMGT家族编码的蛋白均含有GMN序列,同一亚族基因编码蛋白的序列相对保守;PtrMGT家族成员在毛果杨根、茎和叶表达量具有差异;NaCl胁迫下,PtrMGT家族基因在根、茎和叶中表达量在0~48 h内均表现为先上升后下降的变化趋势;ABA处理下,大部分成员表达量先升后降,小部分成员表达量持续下降,表明PtrMGT家族基因对NaCl胁迫与ABA处理产生响应且响应模式出现分化。本研究为深入研究PtrMGT基因家族功能提供理论基础。
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关 键 词: | 毛果杨 MGT 生物信息学分析 盐胁迫 ABA处理 |
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