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暴马丁香的叶绿体微卫星特征分析
引用本文:田甜,王宏霞.暴马丁香的叶绿体微卫星特征分析[J].分子植物育种,2024(8):2501-2507.
作者姓名:田甜  王宏霞
作者单位:1. 青海民族大学生态环境与资源学院;2. 青海民族大学,青海省特色经济植物高值化利用重点实验室
基金项目:青海省自然科学基金项目(2019-ZJ-984Q)资助;
摘    要:暴马丁香具有很高的观赏价值和药用价值。为研究暴马丁香叶绿体微卫星特征,本研究在暴马丁香叶绿体全基因组序列(156 141 bp)的基础上,采用MISA v1.0软件,分析其叶绿体全基因组序列,共识别出231个微卫星位点(平均每676 bp出现一个)。其中,叶绿体微卫星主要集中于大单拷贝区(94.52%),主要由A、T构成。重复序列中主要以单碱基重复序列为主,占重复序列总数的66.97%。微卫星长度集中在8~19 bp,占96.79%,有7个叶绿体微卫星长度大于20 bp,说明暴马丁香叶绿体基因组上的微卫星位点大多数具有多态性的潜能。实验结果为暴马丁香的物种鉴定和系统发育研究提供理论基础。

关 键 词:暴马丁香  微卫星  叶绿体
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