苦瓜McWRKY16基因克隆及表达分析

WRKY转录因子是植物中最大的转录因子家族之一，在各种生物和非生物胁迫响应及多种生长发育过程中发挥着关键作用。用PCR技术克隆McWRKY16基因并进行生物信息学分析，通过实时荧光定量PCR技术分析McWRKY16基因在白粉病菌胁迫下的表达方式。序列分析表明，McWRKY16基因开放阅读框1 007 bp，编码295个氨基酸，其编码蛋白分子量约为32 371.45 kD，理论等电点pl为8.92；蛋白序列中α-螺旋、β-转角、无规则卷曲、延伸链分别占32.2%、1.69%、55.25%、10.85%;McWRKY16蛋白不含信号肽序列，属非跨膜蛋白，预测其亚细胞定位于细胞核；启动子预测结果表明，该基因含有多个响应光照及与生长发育、激素以及胁迫反应相关的顺式调控元件；序列对比与系统进化树分析结果显示，蛋白序列中该基因蛋白序列中包含2个WRKY保守结构域，锌指结构为C2H2型，属于典型的WRKY基因家族中的Ⅱ类；McWRKY16氨基酸序列与拟南芥的AtWRKY18(NP＿567882.1, Arabidopsis thaliana)同源性高达97%，表明McWRKY16蛋白氨基酸序列具有高...