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苹果AAAP基因家族的鉴定与分析
作者姓名:杨阳  付鸿博  刘媛媛
作者单位:1. 吕梁学院生命科学系;2. 山西农业大学园艺学院
基金项目:本研究由山西省高等学校科技创新项目(2020L0696)资助;
摘    要:为了对苹果MdAAAP基因家族的功能进行深入研究,本研究利用生物信息学方法对苹果MdAAAP基因家族进行鉴定,并对其家族成员的生物学信息进行分析。结果表明,在苹果中共鉴定到95个MdAAAP基因家族成员,编码氨基酸在89~569,分子量大小在10.37~62.78 kD,不稳定系数为10.92~76.66,等电点为4.79~9.55,脂肪族氨基酸指数为78.73~142.90,亲水性为-0.426~1.255。亚细胞定位预测结果表明93个MdAAAP蛋白定位在细胞内膜。MdAAAP基因不均匀地分布在18条染色体上。系统进化树分析将MdAAAP基因家族分成8组(AAP, LHT, GAT, ProT, AUX, ANT, ATLa和ATLb),本研究初步了解了苹果MdAAAP基因家族成员的特征和功能,为后期在苹果中该基因的功能研究在分子水平上提供了理论支撑。

关 键 词:苹果  MdAAAP基因家族  生物信息学
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