番茄JAZ家族生物信息学及表达模式分析 |
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作者姓名: | 黄思源 王海 樊若晨 李婉容 李建君 高苗苗 于晓惠 陈银华 |
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作者单位: | 1. 海南大学海南省热带生物资源可持续利用重点实验室;2. 海南大学园艺学院;3. 海南恩红农业科技有限公司 |
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基金项目: | 海南省自然科学基金高层次人才项目(320RC480);;国家自然科学基金项目(31960526)共同资助; |
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摘 要: | 为明确番茄JAZ家族成员的特征,本研究以番茄JAZ家族基因为研究对象,对该家族成员的进化、复制、理化性质、表达模式等进行分析。结果显示,SlJAZs主要分布在番茄的7条染色体上,SlJAZ9、SlJAZ10和SlJAZ11可能在Chr.8上形成串联重复事件。SlJAZs基因结构分析结果显示,内含子数目变异比较大,位于1 (SlJAZ2)~14 (Sl JAZ12)之间。启动子分析结果表明,13个SlJAZs基因启动子顺式作用元件种类和数量存在差异,推测其各自的功能也存在差异。组织表达模式分析表明,SlJAZs基因在番茄在根、茎、叶、花、果间存在不同的表达特性。其中,SlJAZ2、SlJAZ4、SlJAZ6、SlJAZ7、SlJAZ8、SlJAZ11、SlJAZ12、SlJAZ13在花中表达量相对较高;SlJAZ5在根中表达量相对较高;Sl JAZ10在叶片和果中表达相对较高;SlJAZ11在叶片中表达量相对较低,说明SlJAZs基因可能在番茄发育的各个阶段发挥重要作用,本研究为进一步鉴定番茄JAZ的功能提供了参考。
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关 键 词: | 番茄 基因家族 JAZ 表达模式 |
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