玉米棒三叶叶型性状的全基因组关联分析 |
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引用本文: | 白明兴,陆晏天,庄泽龙,陈奋奇,彭云玲.玉米棒三叶叶型性状的全基因组关联分析[J].分子植物育种,2022(8):2463-2477. |
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作者姓名: | 白明兴 陆晏天 庄泽龙 陈奋奇 彭云玲 |
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作者单位: | 1. 甘肃农业大学农学院甘肃省干旱生境作物学重点实验室;2. 甘肃农业大学甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室 |
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基金项目: | 国家重点研发计划子课题(2018YFD0100203-4); |
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摘 要: | 玉米棒三叶(穗上叶,穗叶及穗下叶)对玉米单产的形成起着至关重要的作用,为了深入剖析玉米各性状的遗传基础及挖掘相关性状的基因,本研究以253份玉米自交系为关联群体,利用分布于玉米全基因组上的558 529个单核苷酸多态性标记(SNPs)对玉米棒三叶的叶长、叶宽及叶面积进行全基因组关联分析。结果表明,通过对关联群体性状进行统计可知,不同性状变异系数在17.00%~31.00%,变异丰富;且各性状的峰度和偏度都在-1~1之间,呈典型的数量性状遗传;方差分析也表明,各性状在基因型间都达到极显著差异;相关性分析及层次聚类分析发现,关联群体的各性状间均呈现显著或极显著(P<0.05或P<0.01)正相关关系,且各性状间共同影响着玉米干物质的积累。由主成分分析(principal component analysis, PCA)可知,在棒三叶叶长、叶宽及叶面积间可筛选出对总体方差累计贡献率达89.436%的两个主成分,表明这两个主成可以代表棒三叶叶型性状的绝大多数信息。以P≤3.99×10-6为显著阙值,利用Q模型对供试群体进行关联分析,在玉米叶长、叶宽及叶面积间共...
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关 键 词: | 玉米 棒三叶 SNP标记 全基因组关联分析 |
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