桑葚MaMYB44基因的克隆与生物信息学分析 |
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引用本文: | 李翔宇,赵世成,李文兰.桑葚MaMYB44基因的克隆与生物信息学分析[J].分子植物育种,2022(14):4601-4610. |
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作者姓名: | 李翔宇 赵世成 李文兰 |
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作者单位: | 哈尔滨商业大学药学院 |
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基金项目: | 林木遗传育种国家重点实验室开放课题基金项目(K2017204); |
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摘 要: | 本研究对桑葚(Morus alba L. cv.‘Cheongil’) MaMYB44转录因子进行了生物信息学等的研究,首先对桑葚中MaMYB44基因进行克隆。通过生物信息学分析,发现MaMYB44基因长度为720 bp,编码239个氨基酸,分子质量为58 215.61 Da,理论等电点5.10;通过分析桑葚蛋白MaMYB44的疏水性可知,其中的氨基酸呈现疏水性;通过桑葚MaMYB44蛋白进行跨膜区分析表明,Ma MYB44所有氨基酸都在细胞膜外,无跨膜结构,所以并不是跨膜蛋白;即使有信号肽结构的存在,但是螺旋结构并不存在;然后构建植物表达载体,获取阳性质粒,亚细胞定位后显示MaMYB44基因定位于细胞核中;进一步RT-qPCR分析得出结果,MaMYB44基因在茎中的表达量最高,其次是果实、叶、根。可初步推测该基因主要在桑葚茎中表达并行使功能。
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关 键 词: | 桑葚 MaMYB44基因 基因克隆 生物信息学 基因表达 |
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