不同生长年限桔梗根部差异表达基因挖掘分析

为深入了解不同生长年限桔梗根部基因表达差异，本研究以1年及3年生紫花桔梗根部为试验材料进行转录组分析。共获取41.84 G clean base，拼接后获得54 425个Unigene，平均长度为1 352 bp。筛选得到3 700个DEGs，其中2 514个在3年生样本中上调表达，1 186个下调表达。3 700个差异表达基因共富集到2 975个GO项，52项显著富集。52项显著富集中，分子功能28项，生物学过程21项，细胞组分3项。KEGG富集表明，上调DEGs显著富集到植物病原体互作、淀粉蔗糖代谢、苯丙烷类生物合成和植物激素信号传导途径，下调DEGs显著富集到光合作用-天线蛋白、光合作用、玉米素生物合成途径。同时对各个途径中显著差异表达基因注释到的差异相关蛋白、转录因子及关键酶基因进行挖掘。荧光定量PCR的表达与转录组测序结果的一致性说明转录组测序数据可靠。该研究通过分析不同生长年限桔梗根部转录水平上的差异，有助于理解不同生长年限桔梗产量、结实率及植株抗病性等方面存在的差异，为后期开展桔梗分子育种、生长发育及相关功能基因解析提供基础信息。