基于重测序的3个自封顶番茄品系基因组变异检测分析

自封顶类型番茄品种产量与主茎花序数有密切关系，关于控制花序封顶性状基因的研究报道较多，而对控制番茄封顶花序节位的相关研究报道较少。为研究不同自封顶番茄主茎封顶花序节位之间的遗传变异，筛选出参与调控主茎封顶花序节位相关的候选基因。本试验利用重测序技术对3个番茄品系GXF、AXF和815进行变异检测。结果表明，3个样本共检测到5 968 501个SNP和485 114个InDel，与参考基因组比对后共发生33 473个基因变异，将发生在CDS区的变异基因进行GO和KEGG数据库比对，发现主要集中于基础代谢和玉米素的生物合成。通过基因组序列比对分析，筛选获得16个可能是参与调控番茄主茎封顶花序节位的关键基因。研究结果明确了相关基因的变异位点信息，为进一步研究自封顶番茄花序节位的遗传机理奠定了基础。