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苹果黑星病菌的分子检测
引用本文:商 蓓,付 洁,罗泽青.苹果黑星病菌的分子检测[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2010,38(8):104-110.
作者姓名:商 蓓  付 洁  罗泽青
作者单位:西北农林科技大学 植物保护学院,陕西省农业分子生物学重点实验室;西北农林科技大学 植物保护学院,陕西省农业分子生物学重点实验室;西北农林科技大学 植物保护学院,陕西省农业分子生物学重点实验室
基金项目:教育部长江学者和创新团队发展计划项目(200558);欧盟科技合作项目(ICA4-CT-2001-10001);教育部“111”引智项目(B07049)
摘    要:【目的】建立苹果黑星病菌(Venturia inaequalis(Cooke)Wint)的分子检测方法,以提高检测精确度,缩短检测时间。【方法】根据苹果黑星病菌与其他苹果病原真菌核糖体基因转录间隔区(Internal transcribed spacer,ITS)序列间的差异,设计了1对特异性引物320A/320B,用于苹果黑星病菌的分子检测,对特异性引物扩增条件进行了优化,并验证和检验了引物的特异性和灵敏度。【结果】特异性引物的扩增条带约为320bp,优化的反应体系为:2μL MgCl2(25mmol/L),2.5μL 10×buffer,3μL dNTP(2.5mmol/L),1.2 μL引物320A/320B(10μmol/L),0.5μL聚合酶(5U/μL),1μL模版DNA(30ng/μL),加ddH2O至总体积25μL;反应程序为:94℃3min;94℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸30s,35个循环;72℃延伸10min。利用该对特异性引物对包括苹果黑星病菌在内的26个苹果病原菌菌株基因组DNA进行的PCR扩增表明,只有苹果黑星病菌能扩增到1条约320bp的特异性条带,其他菌株及阴性对照的扩增产物均未检测到特异性条带。对接种苹果黑星病菌的苹果组织的检测表明,该对引物能特异性地检测到苹果黑星病菌的存在,其对苹果黑星病菌基因组DNA检测的灵敏度为100fp/μL。【结论】利用设计的特异性引物320A/320B,参考正交试验优化的体系和程序,结合简单的SDS法提取苹果黑星病菌基因组DNA,在1个工作日内即可完成对该病原菌的分子检测。

关 键 词:苹果黑星病菌  转录间隔区  特异性引物  正交优化
收稿时间:2010/1/18 0:00:00

Molecular detection of Venturia inaequalis
SHANG Bei,FU Jie,LUO Ze-qing,HU Xiao-ping,YANG Jia-rong.Molecular detection of Venturia inaequalis[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2010,38(8):104-110.
Authors:SHANG Bei  FU Jie  LUO Ze-qing  HU Xiao-ping  YANG Jia-rong
Institution:(College of Plant Protection,Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China)
Abstract:
Keywords:Venturia inaequalis  ITS  primer set  optimization
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