基于核基因EF-1a序列的盾蚧亚科7个属的系统发育 |
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引用本文: | 魏久锋,冯纪年,王 鹏.基于核基因EF-1a序列的盾蚧亚科7个属的系统发育[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2009,37(11):149-155. |
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作者姓名: | 魏久锋 冯纪年 王 鹏 |
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作者单位: | (西北农林科技大学 植物保护资源与病虫害防治教育部重点实验室;(西北农林科技大学 植物保护资源与病虫害防治教育部重点实验室;(西北农林科技大学 植物保护资源与病虫害防治教育部重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(30870324);西北农林科技大学创新性实验计划项目(2008022A) |
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摘 要: | 【目的】对盾蚧亚科昆虫的基因序列进行研究,探讨EF-1a基因在该亚科昆虫中的分子进化机制,为我国盾蚧亚科昆虫的分类与鉴定提供理论依据。【方法】以EF-1a为目的基因,对分布于中国的盾蚧亚科雪盾蚧属、白轮蚧属、并盾蚧属、盾蚧属、矢尖蚧属、拟轮蚧属和围盾蚧属7个属13种蚧虫以及2个外群的EF-1a基因进行特异性扩增和测序。使用ClustalX1.83和MEGA4.0系统发育分析软件,对所得DNA序列的碱基组成、碱基替换、遗传距离等进行分析;通过碱基替换饱和性分析进行了信号检验;在MEGA4.0软件中采用最大简约法、邻接法和最小进化法对盾蚧亚科7属的系统发育关系进行分析。【结果】(1)盾蚧亚科7属的EF-1a序列中,T、C、A、G的平均含量分别为23.5%,25.6%,25.5%和25.4%,A+T的含量为49%,G+C的含量为51%。(2)转换频率是颠换频率的1.3倍,转换主要发生在A与G之间,颠换主要发生在A与T之间。(3)碱基替换饱和性分析显示,EF-1a数据集有较强的系统发育信号。系统发育树的结果显示,白轮蚧属、并盾蚧属和雪盾蚧属属同一支,盾蚧属和矢尖蚧属属同一支,围盾蚧属和拟轮蚧属属同一支。【结论】EF-1a基因是盾蚧亚科属级分类单元分子系统发育的有效基因标记之一。
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关 键 词: | 盾蚧亚科 核基因 EF-1a基因 分子系统学 |
收稿时间: | 3/5/2009 12:00:00 AM |
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