| 2007－2009年部分猪群PRRSV ORF5和Nsp2基因的克隆与序列分析 |
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| 引用本文： | 邹 敏,吴发兴,王福军. 2007－2009年部分猪群PRRSV ORF5和Nsp2基因的克隆与序列分析[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2010, 38(10): 7-14 |
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| 作者姓名： | 邹 敏 吴发兴 王福军 |
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| 作者单位： | 青岛易邦生物工程有限公司；青岛科技大学 材料科学与工程学院;中国动物卫生与流行病学中心;青岛易邦生物工程有限公司 |
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| 基金项目： | 国家“十一五”科技支撑计划项目“重大动物疫病病原快速检测技术研究和开发”（2006BAD06A11） |
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| 摘 要： | 【目的】了解2007-2009年部分猪群中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)株的遗传演化规律。【方法】按常规方法,从2007-2009年收集的疑似蓝耳病猪群组织样品中分离PRRSV,应用RT-PCR方法,对分离的10株PRRSV的ORF5和Nsp2基因进行扩增,测序后与19个PRRSV参考毒株的ORF5、Nsp2基因进行核苷酸、氨基酸序列比较及遗传进化分析。【结果】分离到的SDWF5、SDCX1、LN3、LN8、LN12、SD2、SD5、SD14、ZB1、ZB2共10株PRRSV均属于美洲型PRRSV变异株,其ORF5基因全长均为603bp,编码约200个氨基酸,其推导氨基酸序列变异主要发生在9～39位;SDWF5、SDCX1、LN3、LN12、SD2、SD5、SD14、ZB2等8个分离株的Nsp2基因全长为2845bp,编码950个氨基酸,与代表毒株VR-2332相比,8个分离株在Nsp2基因推导氨基酸序列的480和532～560位发生了不连续的30个氨基酸缺失。与19个PRRSV参考毒株的ORF5、Nsp2序列进行比较后发现,10个分离株的ORF5、Nsp2基因核苷酸序列及其推导氨基酸序列均发生了较大变异。遗传进化分析发现,10个分离株与以CH-1a为代表的国内流行毒株处于同一分支,与JXA1等变异毒株的遗传距离较近。【结论】来源于不同猪群的10个PRRSV分离株的遗传关系存在交叉,没有明显的地域特征,但可能具有相同的始祖Ch-1a。
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| 关 键 词： | 猪繁殖与呼吸综合征病毒变异株 ORF5基因 Nsp2基因 遗传变异 |
| 收稿时间： | 2010-03-04 |
Cloning and sequence analysis of ORF5 and Nsp2 genes of porcine reproductive and respiratory syndrome virus from some pig farms in 2007-2009 |
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| ZOU Min,,WU Fa-xing,WANG Fu-jun,LI Jin-ji ,FENG Yang,LIU Lei ,LI Ming-yi ,CHEN Ke-zheng,FAN Gen-cheng,LI Xiao-cheng. Cloning and sequence analysis of ORF5 and Nsp2 genes of porcine reproductive and respiratory syndrome virus from some pig farms in 2007-2009[J]. Journal of Northwest A&F University（Natural Science Edition）, 2010, 38(10): 7-14 |
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| Authors: | ZOU Min WU Fa-xing WANG Fu-jun LI Jin-ji FENG Yang LIU Lei LI Ming-yi CHEN Ke-zheng FAN Gen-cheng LI Xiao-cheng |
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| Affiliation: | ZOU Min1,2,WU Fa-xing3,WANG Fu-jun1,LI Jin-ji 1,FENG Yang1,LIU Lei 1,LI Ming-yi 1,CHEN Ke-zheng2,FAN Gen-cheng1,LI Xiao-cheng3 (1 Yebio Bio-Engineering Co.,Ltd.,of Qingdao,Qingdao,Shandong266032,China,2 College of Materials Science and Engineering,Qingdao University of Science and Technology,Shandong266061,3 China Animal Health and Epidemiology Center,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | variant strain of porcine reproductive and respiratory syndrome virus ORF5 gene Nsp2 gene genetic variation |
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